上述哪項(xiàng)報(bào)告是MET外顯子14跳躍突變?本文教你一文看懂MET檢測報(bào)告! 別擔(dān)心,在閱讀檢測報(bào)告之前,先了解以下信息,做好充分的準(zhǔn)備。 如何理解報(bào)道的突變類型? 對于開頭提到的MET突變類型,比如c。30283A>T,p.S531C,醫(yī)生經(jīng)常對如何理解這些有疑問。事實(shí)上,上述變異是按照HGVS(人類基因組變異協(xié)會(huì),HumanGenomeVariationSociety)標(biāo)準(zhǔn)命名規(guī)則來表示的。它通常包括參考信息的來源[例如“c”。代表編碼DNA的參考序列“p”。代表蛋白質(zhì)(氨基酸)的參考序列]、位置編號(hào)(一般根據(jù)參考序列信息,如c.3028是編碼序列的第3028位核苷酸)和具體變化(DNA水平為核苷酸變化,包括點(diǎn)突變)、ins插入、del刪除等;蛋白質(zhì)水平變化、氨基酸變化)。
一般的DNA變異命名參考的是編碼DNA序列,但非編碼區(qū)可能會(huì)出現(xiàn)一些變異,例如本文描述的MET外顯子14跳躍突變。對于這些變異位點(diǎn),沒有對應(yīng)的位置編號(hào),需要以附近編碼區(qū)的位置編號(hào)作為定位參考,上游用“-”,下游用“”表示。 現(xiàn)在再看看一開始提到的變體。 C。30283A>T,3028編碼核苷酸下游的第三個(gè)非編碼核苷酸發(fā)生點(diǎn)突變,由A變?yōu)門。p.S531C,該蛋白的氨基酸編號(hào)531由??S(絲氨酸)變?yōu)镃(半胱氨酸)。 注:生物信息學(xué)分析時(shí),由于參考轉(zhuǎn)錄本不同,突變會(huì)產(chǎn)生不同的比對結(jié)果,從而導(dǎo)致位置編號(hào)不同。例如,參考MET基因NM_000245.3轉(zhuǎn)錄本,突變?yōu)閏。30283A>T;但如果參考METNM_001127500.3轉(zhuǎn)錄本,相同的突變表示為c。30823甲>T。以下介紹基于NM_000245.3轉(zhuǎn)錄信息。
什么是MET外顯子14跳躍突變? MET外顯子14跳躍突變是指METmRNA中外顯子14丟失的現(xiàn)象,通常是由RNA剪接異常引起的。那么什么是RNA剪接呢 MET外顯子14跳躍突變導(dǎo)致編碼蛋白的近膜結(jié)構(gòu)域(JM)丟失。該結(jié)構(gòu)中的Y1003殘基是E3泛素連接酶CBL的結(jié)合位點(diǎn)。CBL與Y1003殘基結(jié)合會(huì)介導(dǎo)MET的泛素化,導(dǎo)致MET蛋白的降解,這是MET蛋白的主要負(fù)調(diào)節(jié)機(jī)制。當(dāng)該區(qū)域被刪除時(shí),將導(dǎo)致MET受體泛素化減少和MET蛋白降解減少,最終導(dǎo)致下游信號(hào)通路持續(xù)激活,導(dǎo)致腫瘤發(fā)生。
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